LEO Fondet blev grundlagt i 1984 af Dr.h.c. Knud E. Abildgaard, der dengang var ejer af og administrerende direktør i LEO Pharma. Formålet var at sikre LEO Pharmas fremtid som en uafhængig, forskningsbaseret medicinalvirksomhed.
Knud E. Abildgaard overtog virksomheden i 1939, efter at grundlæggeren, Abildgaards svigerfar, farmaceut August Kongsted døde.

Kongsted havde etableret LEO Pharma i sit apotek, Løve Apoteket, i København i 1908 og blev på den måde én af grundlæggerne af den danske medicinalindustri. Foruden sin egen virksomhed var Kongsted med til at starte Nordisk Insulinlaboratorium (der senere blev til Novo Nordisk).